我們使用實驗室凍干機要注意對水冷凝器維護，可能一些小故障，將是后期設備的使用的無形隱患，所以需注意實驗室凍干機重要部位如冷凝器的維護和清潔工作。
冷凍干燥機的主要故障大多由于內部和外部的因素造成，我們應該清洗水冷凝器水垢保證水冷凝器換熱效果，對于一些蒸發壓力低導致低壓開關開路導致的故障更應該順時針調大熱氣旁路閥或更換膨脹閥，查漏、補漏、重新加制冷劑，在檢查過程當中對于一些損壞的冷凍干燥機零部件也應該及時更換。主要表現在了如接通電源除濕機不運轉、壓縮機運行間斷、冷凝壓力過高、冷凝壓力過低、蒸發壓力過高、蒸發壓力過低、系統噪音、出口空氣壓降過大、除濕不良、運行過程中無故停機等原因，處理方法的種類也有很多，例如檢查進線電源開關、熔絲，檢查接線并緊固，檢查低壓開關控制管路是否被堵等蒸發溫度是隨蒸發壓力增高而升高的。
如遇風冷凝器散熱不佳可以用干燥壓縮空氣吹冷凝器，在制冷循環之中有空氣的時候可以從新抽真空、更換制冷劑，膨脹閥感溫包未貼緊蒸發器出口管管壁可以重新安裝好感溫包，此外還有入口壓力壓力過低、環境溫度過高或者是處理風量過大、入口溫度過高的故障情況之下，都用該使工況條件符合銘牌要求或重新選配除濕機；有時候冷凝壓力過高造成高壓開路的時候需要的是調整工況或重新選配除濕機，對于風冷式實驗室凍干機我們應該清除風冷凝器表面積灰保持冷卻風道暢通。
